25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1392 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  100 
 
 		 263 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  40.7 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  40.11 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  36.33 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  35.33 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  37.31 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  41.76 
 
 		 153 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  42.22 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  38.97 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  34.11 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  41.57 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  33.08 
 
 		 151 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  33.08 
 
 		 151 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  37.8 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1071  hypothetical protein  43.18 
 
 		 105 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  35.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  35.21 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  32.53 
 
 		 140 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  31.33 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  32.37 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  31.33 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  40.82 
 
 		 146 aa  45.4  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  41.77 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  55.56 
 
 		 78 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>