17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1240 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  100 
 
 		 274 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  37.94 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  38.75 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  38.49 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  35.46 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  32.56 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  29.82 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  29.82 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  25.51 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  24.68 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  27.69 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.98 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>