More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2862 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  72.46 
 
 		 556 aa  693    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  67.52 
 
 		 543 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  100 
 
 		 537 aa  1051    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  73.13 
 
 		 536 aa  716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  71.14 
 
 		 552 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  75.09 
 
 		 552 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  74.71 
 
 		 538 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  71.05 
 
 		 528 aa  681    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  71.43 
 
 		 540 aa  680    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.87 
 
 		 543 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  74.86 
 
 		 546 aa  687    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.3 
 
 		 541 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  71.54 
 
 		 542 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  75.9 
 
 		 528 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  72.8 
 
 		 538 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.3 
 
 		 541 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  77.69 
 
 		 532 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.3 
 
 		 543 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.3 
 
 		 541 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  65.9 
 
 		 525 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  65.42 
 
 		 536 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  64.43 
 
 		 537 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  66.73 
 
 		 545 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.49 
 
 		 536 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  62.25 
 
 		 568 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.47 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  61.29 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.57 
 
 		 534 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  60.9 
 
 		 551 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  58.33 
 
 		 584 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  56.09 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  51.53 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  51.53 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  51.34 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.04 
 
 		 530 aa  481  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  51.34 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  51.15 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.72 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  51.34 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  51.34 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  51.34 
 
 		 516 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  50.96 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.15 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  50.97 
 
 		 519 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  49.23 
 
 		 515 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  48.73 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.75 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  48.3 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.52 
 
 		 539 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.8 
 
 		 659 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  49.51 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  45.61 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  46.93 
 
 		 554 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  47.11 
 
 		 554 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  50.39 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  46.93 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  47.11 
 
 		 554 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  47.01 
 
 		 552 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  47.01 
 
 		 552 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  48.26 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  44.63 
 
 		 665 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  45.69 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  48.8 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  44.59 
 
 		 584 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  46.68 
 
 		 548 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  46.99 
 
 		 552 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  45.04 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  44.67 
 
 		 584 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  45.32 
 
 		 551 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  45.28 
 
 		 577 aa  429  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  45.47 
 
 		 550 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.32 
 
 		 575 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  47.61 
 
 		 541 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  47.64 
 
 		 553 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  47.61 
 
 		 541 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.59 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  42.79 
 
 		 661 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  45.01 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  44.49 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  44.67 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  45.76 
 
 		 577 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  45.66 
 
 		 546 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  45.13 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  45.13 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  45.1 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  45.6 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  45.6 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  44.3 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  44.94 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  44.51 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  44.74 
 
 		 549 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  44.51 
 
 		 551 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  44.51 
 
 		 551 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  48.34 
 
 		 632 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  44.74 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  44.94 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  44.74 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  44.74 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  44.74 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  44.94 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>