More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2074 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2074  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
617 aa  1199    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3087  serine/threonine protein kinase  45.61 
 
 
530 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  39.74 
 
 
542 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 
608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
716 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
738 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
637 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
589 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 
528 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 
572 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3842  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 
357 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.276356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  36.01 
 
 
586 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
612 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
611 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
548 aa  165  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 
680 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
560 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 
638 aa  163  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.98 
 
 
687 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 
624 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 
547 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 
481 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
520 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
603 aa  158  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 
624 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
608 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  35.49 
 
 
514 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 
632 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2375  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 
651 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
569 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.02 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  38.02 
 
 
742 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
541 aa  154  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 
594 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
696 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
652 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
604 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
646 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.6 
 
 
618 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 
616 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
694 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
644 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.87 
 
 
932 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.84 
 
 
557 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
754 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.36 
 
 
835 aa  150  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
421 aa  150  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
542 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 
544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 
617 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.09 
 
 
585 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2075  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
548 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.802718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 
508 aa  146  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
455 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  35.88 
 
 
637 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
535 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
569 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
551 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.72 
 
 
496 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.29 
 
 
806 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
292 aa  144  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.33 
 
 
751 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
555 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 
743 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 
352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
734 aa  142  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.56 
 
 
898 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1141  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
304 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
620 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0921  protein kinase  37.69 
 
 
651 aa  140  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0130475  normal  0.23221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.33 
 
 
520 aa  140  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.6 
 
 
664 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 
837 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  35.04 
 
 
545 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.11 
 
 
673 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
870 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.05 
 
 
716 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
630 aa  138  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8116  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.89 
 
 
654 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4047  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.14 
 
 
916 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
550 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
564 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.05 
 
 
761 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  38.64 
 
 
651 aa  136  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.24 
 
 
833 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8117  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.45 
 
 
733 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 
870 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8619  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.46 
 
 
1148 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 
644 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
721 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4380  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.68 
 
 
1153 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594701  normal  0.339679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.27 
 
 
729 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 
676 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>