More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1889 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1889  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2816  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  72.65 
 
 
234 aa  348  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.928214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6697  phosphoadenosine phosphosulfate  71.1 
 
 
242 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2246  adenylylsulfate reductase  69.91 
 
 
241 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.445437  normal  0.0256026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1786  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  67.12 
 
 
241 aa  319  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0517285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2349  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  64.19 
 
 
248 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.54974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7377  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  56.89 
 
 
246 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833436  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1737  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.11 
 
 
239 aa  277  9e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14253  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1072  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  57.78 
 
 
241 aa  272  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.069664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12820  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  56.95 
 
 
233 aa  271  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  58.64 
 
 
251 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3488  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.66 
 
 
231 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3475  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.66 
 
 
231 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3538  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.66 
 
 
231 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4379  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  54.74 
 
 
235 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3858  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.5 
 
 
232 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0787584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3703  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.36 
 
 
256 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12420  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.36 
 
 
254 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0661  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  54.98 
 
 
274 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.143312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0717  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.25 
 
 
303 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.528578  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5165  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.36 
 
 
231 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2685  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  51.54 
 
 
240 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6103  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  55.66 
 
 
223 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1237  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  52.19 
 
 
231 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0431242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3167  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  51.3 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2772  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  50.45 
 
 
240 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  53.77 
 
 
223 aa  234  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09970  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  52.47 
 
 
241 aa  228  8e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4834  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  50.67 
 
 
233 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3124  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  50.22 
 
 
263 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2819  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  50.22 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000269354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  48.39 
 
 
248 aa  214  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4821  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  47.75 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  45.61 
 
 
229 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.35 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  45.21 
 
 
251 aa  198  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  44.4 
 
 
234 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.91 
 
 
234 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.48 
 
 
235 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  40.65 
 
 
234 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.46 
 
 
226 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.46 
 
 
226 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  39.46 
 
 
243 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  40.19 
 
 
234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.19 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  38.33 
 
 
234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  40.19 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.45 
 
 
234 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.59 
 
 
235 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  44.39 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.77 
 
 
234 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.19 
 
 
234 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  39.72 
 
 
234 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0768  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.81 
 
 
268 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.572293  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3128  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.99 
 
 
227 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.377353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  44.13 
 
 
224 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1409  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.45 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.05 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.43 
 
 
285 aa  161  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.6 
 
 
263 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1395  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.4 
 
 
254 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.3 
 
 
246 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2560  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  43.32 
 
 
270 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.45 
 
 
241 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2535  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  35.45 
 
 
239 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2110  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  41.15 
 
 
240 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0957  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  38.69 
 
 
220 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.347212  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.36 
 
 
251 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0256913  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3330  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  40.18 
 
 
241 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0855113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0592  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.1 
 
 
251 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1941  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.91 
 
 
238 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1642  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), adenylyl-sulfate kinase  42.08 
 
 
462 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1044  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.36 
 
 
244 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1155  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.79 
 
 
248 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0369  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.28 
 
 
263 aa  149  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0962  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  40.91 
 
 
238 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000000110311  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1561  adenylylsulfate reductase thioredoxin dependent  38.2 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1759  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.74 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4056  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.05 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.957521  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2200  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  38.5 
 
 
239 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.096364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.17 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1152  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.5 
 
 
251 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2761  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.96 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0156  phosphoadenosine phosphosulfate reductase CysH-type  37.09 
 
 
238 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000863564  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3317  translation initiation factor IF-2  40.29 
 
 
222 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0935287  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4011  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.39 
 
 
243 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3123  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  41.05 
 
 
245 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.272628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2722  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  41.05 
 
 
245 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000076333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2777  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  36.84 
 
 
252 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278239  normal  0.0478398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0822  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.16 
 
 
246 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109635  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0049  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.53 
 
 
241 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4113  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  35.39 
 
 
250 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1226  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.75 
 
 
234 aa  142  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0928786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3311  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  39.46 
 
 
234 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2615  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  35.24 
 
 
233 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3561  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.18 
 
 
254 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0182  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37 
 
 
252 aa  141  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1772  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  37.91 
 
 
237 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.897862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  36.65 
 
 
239 aa  141  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2356  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  39.74 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>