17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0545 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  340  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  36.03 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  35.29 
 
 		 321 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  35.29 
 
 		 321 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  35.29 
 
 		 321 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  33.09 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  30.15 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  42.36 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  31.88 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  31.39 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  31.85 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  30.66 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  33.68 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  30.84 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  28.46 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  26.83 
 
 		 226 aa  41.2  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  29.03 
 
 		 119 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>