32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0528 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0528  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  56.21 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0933  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  55.56 
 
 		 456 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.38 
 
 		 387 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4234  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.86 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.43 
 
 		 248 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.55 
 
 		 268 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  37.04 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  41.38 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.92 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.77 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.92 
 
 		 245 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  46.55 
 
 		 255 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5428  response regulator receiver and ANTAR domain protein  52.17 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  43.4 
 
 		 235 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.48 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.48 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.71 
 
 		 227 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.71 
 
 		 227 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.71 
 
 		 227 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.61 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.29 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.38 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.29 
 
 		 268 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.57 
 
 		 194 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  35 
 
 		 242 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  46.15 
 
 		 265 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.38 
 
 		 244 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.55 
 
 		 266 aa  40.8  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3428  ANTAR domain protein  37.1 
 
 		 93 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.68 
 
 		 254 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>