30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4837 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  100 
 
 		 247 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  44.4 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  52.81 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  41.9 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  41.77 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  40.87 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  40.83 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  41.24 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  31.52 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  36.27 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  40.52 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  37.78 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  45.63 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  34.08 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  40.2 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  38.38 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  42.71 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  38.71 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  37.01 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  37.18 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  39.74 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  30.73 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  37.23 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  36.36 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 314 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  42.37 
 
 		 218 aa  42  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>