46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3140 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3140  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.035847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  34.02 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  26.61 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.43 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  22.33 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  32.88 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  34.72 
 
 		 436 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  23 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  44.93 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  35.21 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  27.08 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  27.08 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  33.77 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  24.51 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  21.21 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 111 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 107 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  31.88 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.56 
 
 		 437 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.32 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  21.92 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.85 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  24.24 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 115 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>