62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1694 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  100 
 
 		 525 aa  1077    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  25.51 
 
 		 604 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  24.45 
 
 		 635 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  25.28 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 595 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  27.42 
 
 		 607 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  25.39 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  26.38 
 
 		 602 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  24.78 
 
 		 634 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  24.78 
 
 		 634 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  24.78 
 
 		 634 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  24.78 
 
 		 634 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  23.9 
 
 		 603 aa  94  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  26.4 
 
 		 603 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  26.65 
 
 		 626 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  25.17 
 
 		 616 aa  90.1  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  26.51 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  24.09 
 
 		 634 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  26.51 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  23.76 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  25.3 
 
 		 604 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  25 
 
 		 604 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  24.06 
 
 		 627 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  24.01 
 
 		 628 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  24.44 
 
 		 624 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  24.06 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  22.83 
 
 		 631 aa  84.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  25.18 
 
 		 605 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  26.08 
 
 		 605 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  23.67 
 
 		 617 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  26.81 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  25.65 
 
 		 605 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  23.08 
 
 		 603 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  24.16 
 
 		 628 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  24.29 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  22.29 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  23.99 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  23.84 
 
 		 629 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  24.27 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  22.44 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  26.22 
 
 		 677 aa  75.1  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  21.78 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  24.47 
 
 		 604 aa  72  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  24.78 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1484  hypothetical protein  24.68 
 
 		 481 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  25 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  21.31 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  23.08 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  22.68 
 
 		 658 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  26.39 
 
 		 596 aa  60.1  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  19.77 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  23.8 
 
 		 666 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  21.48 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  23.94 
 
 		 672 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  24.82 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  24.82 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  24.82 
 
 		 689 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  24.29 
 
 		 721 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  26.67 
 
 		 576 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  24.19 
 
 		 573 aa  47.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  24.46 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  23.48 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>