223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1432 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 339 aa  686    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  46.39 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  46.77 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  42.04 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  42.11 
 
 		 341 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  42.47 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  43.03 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  42.11 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  42.11 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  42.11 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  41.67 
 
 		 352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  41.8 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  43.34 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  40.74 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  41.49 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  41.8 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  41.49 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  41.49 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  38.84 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  41.49 
 
 		 342 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  40.8 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  41.18 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  41.49 
 
 		 341 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  41.18 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  42.04 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  39.63 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  43.21 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  42.72 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  41.4 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  41.4 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  41.4 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  41.72 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  41.49 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  42.63 
 
 		 324 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  40.25 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  40.94 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  43.3 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  40.62 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  41.08 
 
 		 323 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  41.08 
 
 		 323 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  39.21 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  39.57 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  39.57 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  39.75 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  41.46 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  35.53 
 
 		 338 aa  241  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  35.71 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  35.71 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  36.65 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  37.04 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  35.83 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  35.83 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  37.96 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  37.04 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  35.09 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  35.65 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  34.14 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  34.16 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  34.16 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  34.16 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  34.16 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  33.85 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  37.3 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  33.85 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  33.85 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  33.85 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  37.04 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  37.04 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  35.85 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  34.47 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  36.09 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  34.16 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  35.42 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  35.71 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  35.91 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  33.95 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  37.5 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  35.09 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  33.75 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  33.75 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  33.75 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  37.86 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  33.02 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  35.51 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  35.78 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  34.77 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  33.75 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  33.64 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  34.05 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  36.48 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  35.6 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  35.6 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  34.58 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  34.88 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  34.06 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  34.57 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  34.57 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  34.57 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  34.57 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>