106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0762 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0762  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  209  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.111351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1391  putative transcriptional regulator, MerR family  77.57 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4057  transcriptional regulator, MerR family  71.3 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3756  putative transcriptional regulator, MerR family  58.56 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 305 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 283 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4611  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 336 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 354 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2322  transcription regulator protein  33.04 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.161487 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  41.25 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  40.79 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  38.36 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  37.14 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 339 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 252 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 345 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 335 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6040  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 128 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 126 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 134 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  44.12 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 342 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 342 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.83 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 342 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  47.92 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.71 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.57 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>