24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2732 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  35.35 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  36.18 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  30.63 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  30.96 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  31.44 
 
 		 495 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  32.24 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  32.42 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  30.18 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.38 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  28.69 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  31.11 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  28.27 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  30.89 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.68 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.47 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  36.67 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.67 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 		 531 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  30.06 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  25.12 
 
 		 459 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2443  putative chemotaxis transducer  34.02 
 
 		 531 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 663 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1987  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 224 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.468867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>