25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2979 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2979  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0251583  normal  0.510052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3366  putative aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  33.18 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  32.99 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  27.93 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2688  aminoglycoside phosphotransferase  23.97 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  42 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  44.19 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  29.38 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  60 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  23.93 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  23.4 
 
 		 367 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  24.26 
 
 		 366 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.26 
 
 		 366 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  35.38 
 
 		 382 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 		 380 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>