More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2712 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  100 
 
 		 367 aa  745    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  61.9 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  39.18 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  38.62 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  34.17 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  38.32 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  36.74 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  41.6 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  35.31 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  37.4 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  41.6 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  35.57 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  42.55 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  34.44 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  31.09 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  36.33 
 
 		 357 aa  193  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  35.4 
 
 		 323 aa  193  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  29.59 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  34.33 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  32.95 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  33.88 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  38.46 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  35.52 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  34.79 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  31.61 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  35.36 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  32.7 
 
 		 365 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  32.43 
 
 		 365 aa  179  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  32.7 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  32.7 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  32.7 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  32.7 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  32.43 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  35.95 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  32.43 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  32.7 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  31.23 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  32.54 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  40.98 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  37.06 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  32.25 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  34.16 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0189  peptidase M24  29.58 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0275902  normal  0.05907 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  32.43 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  33.43 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  34.46 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  34.46 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  31.64 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  32.88 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  32.87 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  33.7 
 
 		 376 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  35.33 
 
 		 371 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  34.55 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  34.55 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  35.45 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  31.51 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  36.68 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  30.81 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0720  peptidase M24  35.29 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  33.96 
 
 		 373 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  33.88 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  33.51 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1010  peptidase M24  36.84 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  33.8 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  32.28 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  33.8 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  31.23 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  33.52 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  30.66 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  35.16 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  33.98 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  32.69 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0291  peptidase M24  39.5 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  32.62 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  30.75 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  36.36 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0731  peptidase M24  37.67 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000317312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  34.2 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  30.75 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  40.61 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  32.22 
 
 		 403 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  32.31 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  37.5 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  31.89 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  39.37 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  30.41 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1205  peptidase M24  35.5 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  32.97 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  31.97 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  29.95 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  33.04 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  37.23 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  41.28 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  32.37 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  28.18 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  36.25 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  30.84 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  32.42 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  32.69 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  42.73 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>