76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1976 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.59 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.36 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.36 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.36 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.36 
 
 		 299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.15 
 
 		 294 aa  361  9e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.02 
 
 		 299 aa  358  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.76 
 
 		 296 aa  354  8.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.89 
 
 		 301 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.09 
 
 		 298 aa  350  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.42 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.72 
 
 		 295 aa  346  2e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.86 
 
 		 296 aa  345  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.32 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.45 
 
 		 296 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.86 
 
 		 296 aa  341  8e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.73 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.25 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.84 
 
 		 296 aa  338  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.84 
 
 		 296 aa  338  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.56 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.9 
 
 		 321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60 
 
 		 300 aa  335  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.11 
 
 		 298 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.76 
 
 		 296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  56.06 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.08 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.08 
 
 		 299 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.48 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.56 
 
 		 296 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  31.45 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  32.43 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.43 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  29.41 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  28.53 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  29.41 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  29.18 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  29.11 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  28.93 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  29.07 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.62 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  27.08 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  27.54 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  33.52 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  28.81 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  28.07 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  31.77 
 
 		 336 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  31.67 
 
 		 343 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  31.77 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  27.46 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  29.61 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  27.8 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  31.22 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  29.87 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  27.36 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  26.38 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  28.21 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  26.06 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  31.94 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  26.38 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  28.72 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  27.45 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  30.4 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  32.31 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  32.22 
 
 		 341 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  29.73 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  27.27 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  32.77 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  30.24 
 
 		 340 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  26.29 
 
 		 653 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  29.17 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  27.33 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  27.37 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>