More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1084 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1084  folylpolyglutamate synthetase, putative  100 
 
 
450 aa  928    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 
443 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  32.75 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.32 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  32.08 
 
 
441 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  32.5 
 
 
434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  32.89 
 
 
438 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 
451 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  29.33 
 
 
435 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  32.7 
 
 
408 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  31.29 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.48 
 
 
432 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  30.38 
 
 
463 aa  187  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  28.91 
 
 
419 aa  186  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  29.52 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  31.85 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.69 
 
 
457 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.04 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  34.72 
 
 
433 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  33.78 
 
 
404 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  30.04 
 
 
817 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  29.95 
 
 
428 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  28.77 
 
 
422 aa  176  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.92 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  30.47 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  30.25 
 
 
432 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  33.6 
 
 
404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  31.22 
 
 
436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  29.74 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  28.54 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  29.04 
 
 
425 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  29.4 
 
 
438 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.49 
 
 
428 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  30.87 
 
 
453 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  28.9 
 
 
416 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 
429 aa  170  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1277  FolC bifunctional protein  30 
 
 
419 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.12741  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  31.82 
 
 
429 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  26.68 
 
 
461 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.93 
 
 
433 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  29.56 
 
 
413 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  31.21 
 
 
429 aa  168  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 
435 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  30.22 
 
 
438 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  33.43 
 
 
407 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  29.11 
 
 
474 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 
437 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.4 
 
 
424 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.94 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  30.16 
 
 
431 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  32.41 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  30.19 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  32.91 
 
 
425 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.41 
 
 
433 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  30.79 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  31.03 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.63 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.63 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.63 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.63 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  30.99 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.06 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  31.19 
 
 
413 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.94 
 
 
466 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.18 
 
 
433 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  29.36 
 
 
423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  27.29 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  29.49 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  29.98 
 
 
424 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  28.94 
 
 
432 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  29.02 
 
 
847 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  27.92 
 
 
450 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  31.35 
 
 
442 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.7 
 
 
433 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  30.4 
 
 
485 aa  161  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  30.43 
 
 
445 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 
414 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  27.46 
 
 
444 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.39 
 
 
470 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.35 
 
 
427 aa  160  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  30.65 
 
 
431 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  27.94 
 
 
438 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  30.5 
 
 
433 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  28.03 
 
 
813 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  34.54 
 
 
424 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  28.91 
 
 
430 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  28.36 
 
 
424 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  29.45 
 
 
438 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  30.28 
 
 
543 aa  157  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  29.6 
 
 
526 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  27.92 
 
 
468 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  30.89 
 
 
437 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  29.58 
 
 
422 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0448  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  29.56 
 
 
382 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  27.92 
 
 
444 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  29.64 
 
 
443 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  27.49 
 
 
840 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  31.53 
 
 
430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>