More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1277 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1277  FolC bifunctional protein  100 
 
 
419 aa  857    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.12741  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0733  folylpolyglutamate synthase  36.78 
 
 
441 aa  225  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.136275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.99 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33 
 
 
441 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.72 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  34 
 
 
441 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  33.68 
 
 
424 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
432 aa  209  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.75 
 
 
429 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  32.68 
 
 
424 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  33.5 
 
 
413 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  32.66 
 
 
424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
431 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  34.41 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  32.65 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 
428 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  33.92 
 
 
425 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.91 
 
 
427 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0673  FolC bifunctional protein  32.59 
 
 
436 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.84 
 
 
424 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.92 
 
 
416 aa  193  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 
431 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  30.86 
 
 
424 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  35.31 
 
 
426 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.6 
 
 
433 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.69 
 
 
433 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.75 
 
 
428 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.41 
 
 
431 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.24 
 
 
429 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.28 
 
 
457 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.91 
 
 
435 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  32.3 
 
 
427 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 
451 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  32.51 
 
 
419 aa  187  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.83 
 
 
416 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  30.79 
 
 
438 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  31.27 
 
 
428 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  30.79 
 
 
424 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  32.91 
 
 
404 aa  186  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  31.77 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  29.67 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.61 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.46 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.46 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  32.23 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  31.87 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.46 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.24 
 
 
433 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.24 
 
 
433 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.24 
 
 
433 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  33.41 
 
 
427 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  32.92 
 
 
433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  32.4 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  29.41 
 
 
425 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  33.81 
 
 
438 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  32.41 
 
 
429 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.31 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.59 
 
 
443 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.89 
 
 
433 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  30.42 
 
 
437 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  34.32 
 
 
438 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  30.98 
 
 
433 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  32.18 
 
 
422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  37.04 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  30.14 
 
 
465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  30.54 
 
 
454 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
414 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  30.96 
 
 
413 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.66 
 
 
429 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  30.66 
 
 
436 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  30.17 
 
 
435 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  30.17 
 
 
437 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0455  folylpolyglutamate synthase  30.9 
 
 
393 aa  171  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  30.09 
 
 
440 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.72 
 
 
447 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1084  folylpolyglutamate synthetase, putative  30 
 
 
450 aa  169  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  29.81 
 
 
422 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  30.16 
 
 
381 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  30.73 
 
 
453 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  31.71 
 
 
412 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  32.67 
 
 
422 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  30.86 
 
 
422 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  31.03 
 
 
847 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  28.92 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  29.17 
 
 
444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  28.92 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  31.35 
 
 
485 aa  164  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  29.5 
 
 
438 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  32.32 
 
 
448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  31.47 
 
 
403 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.03 
 
 
418 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  29.34 
 
 
461 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  31.35 
 
 
441 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  32.03 
 
 
418 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  31.38 
 
 
426 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  29.89 
 
 
444 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  31.53 
 
 
430 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  29.88 
 
 
428 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  30.71 
 
 
463 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>