More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0722 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0722  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 157 aa  324  2.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0592773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  59.49 
 
 		 158 aa  194  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 		 155 aa  190  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  58.6 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  56.96 
 
 		 158 aa  183  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0660  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16016  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  58.6 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  54.84 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  180  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  55.62 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>