45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0579 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  100 
 
 
649 aa  1329    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  23.22 
 
 
604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  24.45 
 
 
655 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  23.7 
 
 
646 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.43 
 
 
676 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  23.52 
 
 
674 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.96 
 
 
622 aa  94  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.29 
 
 
663 aa  90.1  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  23.23 
 
 
653 aa  90.1  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  22.98 
 
 
689 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.09 
 
 
638 aa  79.7  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  23.19 
 
 
686 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  22.83 
 
 
680 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  22.98 
 
 
686 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  21.66 
 
 
689 aa  77.4  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  31.51 
 
 
651 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.06 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.23 
 
 
592 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  23.62 
 
 
648 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  25.74 
 
 
649 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  21 
 
 
749 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  21.93 
 
 
644 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.23 
 
 
659 aa  64.3  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.02 
 
 
643 aa  63.9  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  26.32 
 
 
658 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  25.4 
 
 
657 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.04 
 
 
726 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.83 
 
 
637 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.89 
 
 
590 aa  57.4  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  19.91 
 
 
712 aa  55.1  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  33.33 
 
 
615 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.73 
 
 
733 aa  55.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  34.15 
 
 
619 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  34.15 
 
 
615 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.73 
 
 
674 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  29.03 
 
 
661 aa  52  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.89 
 
 
618 aa  50.8  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.06 
 
 
643 aa  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  31.25 
 
 
625 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.3 
 
 
649 aa  48.5  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.04 
 
 
623 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.79 
 
 
658 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.86 
 
 
458 aa  46.2  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  25.12 
 
 
646 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  20 
 
 
746 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>