More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12465 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  58.79 
 
 
683 aa  759    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  56.66 
 
 
691 aa  757    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  53.62 
 
 
685 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  58.06 
 
 
692 aa  803    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  55.18 
 
 
682 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  64.54 
 
 
699 aa  878    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  51.61 
 
 
714 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  67.06 
 
 
690 aa  906    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  53.5 
 
 
704 aa  725    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  64.66 
 
 
684 aa  890    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  81.76 
 
 
680 aa  1165    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  59.58 
 
 
687 aa  795    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  81.15 
 
 
680 aa  1146    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  58.82 
 
 
686 aa  808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  50.34 
 
 
802 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  55.49 
 
 
678 aa  700    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  67.21 
 
 
690 aa  909    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  65.54 
 
 
679 aa  892    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  53.36 
 
 
716 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  67.75 
 
 
679 aa  890    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  71.26 
 
 
680 aa  997    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  81.76 
 
 
680 aa  1165    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  60.97 
 
 
681 aa  797    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  67.21 
 
 
682 aa  892    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  66.32 
 
 
678 aa  889    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  67.3 
 
 
679 aa  913    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  67.35 
 
 
690 aa  911    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  50.59 
 
 
689 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  68.23 
 
 
681 aa  944    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  81.76 
 
 
680 aa  1165    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  79.82 
 
 
680 aa  1123    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  68.52 
 
 
686 aa  891    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  100 
 
 
738 aa  1505    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  43.71 
 
 
642 aa  528  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  44.39 
 
 
652 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  41.64 
 
 
645 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  40.8 
 
 
647 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  41.97 
 
 
676 aa  475  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  61.92 
 
 
846 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  39.25 
 
 
647 aa  460  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  38.67 
 
 
635 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  38.52 
 
 
635 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  39.47 
 
 
644 aa  429  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  31.92 
 
 
650 aa  295  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  29.91 
 
 
600 aa  273  6e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  29.94 
 
 
587 aa  203  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  29.28 
 
 
576 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29.11 
 
 
576 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  26.43 
 
 
583 aa  178  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  25.98 
 
 
573 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  29.94 
 
 
598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  31.05 
 
 
599 aa  165  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.24 
 
 
577 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  30.47 
 
 
554 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  29.4 
 
 
586 aa  158  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  25.39 
 
 
575 aa  156  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  28.37 
 
 
556 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  25.42 
 
 
564 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.04 
 
 
552 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  28.38 
 
 
611 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.24 
 
 
574 aa  152  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.91 
 
 
566 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.17 
 
 
566 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  28.73 
 
 
590 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.85 
 
 
542 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  29.73 
 
 
567 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  27.7 
 
 
571 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  28.75 
 
 
591 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  25.6 
 
 
567 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  25.76 
 
 
566 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26 
 
 
566 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  28.1 
 
 
545 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.14 
 
 
577 aa  143  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.65 
 
 
542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26.81 
 
 
567 aa  142  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.81 
 
 
567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.31 
 
 
577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  23.63 
 
 
543 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.21 
 
 
535 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  25.86 
 
 
562 aa  140  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  25.61 
 
 
561 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  25.45 
 
 
546 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  27.42 
 
 
559 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.13 
 
 
597 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  27.53 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  27.39 
 
 
556 aa  138  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  26.95 
 
 
539 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  26.47 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.45 
 
 
538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  25.14 
 
 
561 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  25.8 
 
 
582 aa  135  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  27.26 
 
 
577 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  25.14 
 
 
561 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.88 
 
 
591 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  27.39 
 
 
583 aa  134  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  23.44 
 
 
554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.26 
 
 
658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  29.26 
 
 
584 aa  132  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  24.71 
 
 
536 aa  131  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.14 
 
 
540 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>