43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10421 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  55.88 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  55.88 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  55.88 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  55.88 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.76 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.18 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  39.13 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.27 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 68 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 66 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  34.62 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.66 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.88 
 
 		 326 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  35.29 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.27 
 
 		 70 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>