44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0495 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  361  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  45.19 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  44.53 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  41.1 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  40.28 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  31.29 
 
 		 190 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  36.67 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  36.67 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  29.46 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  40.3 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  42.65 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  26.28 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  24.43 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  25.98 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  29.01 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  28.87 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  25.4 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  27.78 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  27.46 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  24.41 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2246  hypothetical protein  31.36 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  23.02 
 
 		 132 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  25.2 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  24.81 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  23.14 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0590  hypothetical protein  31 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  23.14 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  25.76 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2777  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  45.83 
 
 		 85 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  27.34 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.28143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  30.83 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  24.64 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  28.68 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  27.48 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  25.76 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  26.85 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  25.76 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  27.5 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  26.52 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>