37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1777 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  74.85 
 
 		 173 aa  271  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  62.21 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  46.84 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1763  hypothetical protein  45.14 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.893095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04851  hypothetical protein  46.38 
 
 		 139 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04871  hypothetical protein  35.48 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0908407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0431  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04561  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04941  hypothetical protein  34.23 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.67443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  27.74 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  32.76 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  24.52 
 
 		 185 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  29.81 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0796  hypothetical protein  26.75 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5098  protein of unknown function DUF721  28.77 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0628947  normal  0.0645069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  28.95 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  29.47 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  28.07 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4084  hypothetical protein  25.66 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  26.29 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  31.65 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  26.29 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  29.59 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  30.53 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  30.77 
 
 		 105 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  28.24 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  29.41 
 
 		 171 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  27.72 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  26.53 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2673  protein of unknown function DUF721  25.93 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.212988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  32.08 
 
 		 152 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  26.98 
 
 		 153 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>