16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0531 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  100 
 
 		 170 aa  351  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  87.65 
 
 		 186 aa  318  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  61.18 
 
 		 170 aa  231  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  56.6 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  50 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  52.87 
 
 		 163 aa  184  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  53.57 
 
 		 215 aa  175  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  52.6 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  44.06 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  40.76 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  40.76 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  39.24 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  36.59 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  57.58 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  28.83 
 
 		 351 aa  40.8  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>