More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0228 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  85.83 
 
 
487 aa  829    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  100 
 
 
487 aa  963    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  64.26 
 
 
485 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  76.53 
 
 
487 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  60.57 
 
 
486 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  60.78 
 
 
486 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  46.28 
 
 
486 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  45.47 
 
 
484 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  46.53 
 
 
484 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  45.68 
 
 
484 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  48.65 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  48.96 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.76 
 
 
480 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  45.76 
 
 
480 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  51.46 
 
 
484 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  46.35 
 
 
479 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  48.42 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  47.07 
 
 
490 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.33 
 
 
469 aa  323  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  40.2 
 
 
478 aa  312  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  39.96 
 
 
469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  36.17 
 
 
457 aa  293  6e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.58 
 
 
469 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  37.39 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.87 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  37.71 
 
 
468 aa  289  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.13 
 
 
469 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.89 
 
 
469 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  35.21 
 
 
470 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  37.98 
 
 
474 aa  276  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  35.88 
 
 
458 aa  274  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  37.61 
 
 
471 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  34.03 
 
 
467 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  36.27 
 
 
488 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.2 
 
 
475 aa  264  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.87 
 
 
475 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.06 
 
 
472 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  33.82 
 
 
467 aa  256  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  35.5 
 
 
475 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.2 
 
 
473 aa  252  8.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.48 
 
 
470 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  34.7 
 
 
472 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.18 
 
 
475 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  32.23 
 
 
473 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  35.25 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.58 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.37 
 
 
474 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  34.02 
 
 
472 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  35.54 
 
 
471 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.4 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.33 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.85 
 
 
472 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  33.4 
 
 
486 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  32.7 
 
 
460 aa  237  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  32.63 
 
 
460 aa  237  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.44 
 
 
466 aa  237  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  32.84 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.01 
 
 
464 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  35.21 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.72 
 
 
472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  32.56 
 
 
460 aa  233  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  32.63 
 
 
460 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  37.6 
 
 
482 aa  229  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  34.75 
 
 
470 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.58 
 
 
472 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  33.91 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.26 
 
 
484 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  31.37 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  29.38 
 
 
474 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  34.06 
 
 
409 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  33.58 
 
 
414 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  33.14 
 
 
503 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  30.42 
 
 
465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  30.12 
 
 
501 aa  196  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  29.79 
 
 
470 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  29.61 
 
 
470 aa  193  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.96 
 
 
471 aa  192  9e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  32.71 
 
 
473 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  31.78 
 
 
733 aa  190  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  29.31 
 
 
470 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  28.66 
 
 
470 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  30.75 
 
 
468 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.73 
 
 
449 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  30.02 
 
 
460 aa  141  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  29 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.16 
 
 
518 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  27.84 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  29.29 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  29.13 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2853  phosphoglucosamine mutase  28.84 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0873  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  25.54 
 
 
564 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3769  phosphoglucosamine mutase  28.28 
 
 
490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00158807  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.17 
 
 
456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.22 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17410  alpha-phosphoglucomutase  26.92 
 
 
581 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  31.58 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  30.18 
 
 
450 aa  126  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  27.88 
 
 
452 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  29.79 
 
 
446 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  26.67 
 
 
451 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>