More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0126 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  100 
 
 
80 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  96.25 
 
 
80 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  95 
 
 
103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  92.5 
 
 
80 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  92.5 
 
 
80 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  91.25 
 
 
80 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  85 
 
 
80 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  85 
 
 
79 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  85 
 
 
79 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  83.75 
 
 
79 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  81.25 
 
 
80 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  66.67 
 
 
81 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  69.14 
 
 
84 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  65.33 
 
 
81 aa  100  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  65.28 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  64 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  63.51 
 
 
74 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  72.06 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  64 
 
 
76 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  65.38 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  57.69 
 
 
82 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  68.57 
 
 
75 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  68.06 
 
 
78 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  68.06 
 
 
78 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  61.04 
 
 
80 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  63.01 
 
 
74 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  59.46 
 
 
78 aa  93.2  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  64.1 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  65.28 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  62.34 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  62.16 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  61.64 
 
 
73 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  61.33 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  65.75 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  64.38 
 
 
78 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  65.28 
 
 
79 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  64.86 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  64.86 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  60 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  68.57 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  67.14 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  63.51 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  58.11 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  57.5 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  65.28 
 
 
76 aa  90.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  60.56 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  64.29 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  61.33 
 
 
79 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  58.9 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  68.06 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  63.01 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  61.25 
 
 
80 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  66.2 
 
 
77 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  62.5 
 
 
78 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  63.38 
 
 
78 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  64.47 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  52.56 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  65.22 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  65.22 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  56.41 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  64.29 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  60 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  64 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  64 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  60 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  60.56 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  60.56 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  61.64 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  61.64 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  57.33 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  61.64 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  64 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  63.51 
 
 
77 aa  87  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  64.38 
 
 
79 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>