44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3261 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  45.71 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  46.43 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  44.64 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.82 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  44.49 
 
 		 235 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  45.09 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  45.09 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  43.75 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  45.09 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  43.3 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  42.86 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.86 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.86 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 264 aa  164  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  39.11 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.66 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  33.73 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.62 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  33.73 
 
 		 280 aa  121  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  39.07 
 
 		 217 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1915  hypothetical protein  29.53 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000228464  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  29.57 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  32.44 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  34.26 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  32.39 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1538  hypothetical protein  38.78 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1537  hypothetical protein  49.38 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  25.65 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  25.68 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  26.6 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00120  hypothetical protein  26.67 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  32.87 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5748  lipolytic protein G-D-S-L family  27.14 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  27.81 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.88 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4253  hypothetical protein  38.96 
 
 		 384 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.274171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  27.13 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  24.61 
 
 		 368 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  23.33 
 
 		 188 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>