More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2752 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  100 
 
 
144 aa  296  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  99.31 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  80.56 
 
 
144 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  69.57 
 
 
148 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  69.57 
 
 
148 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  69.57 
 
 
148 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  69.57 
 
 
148 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  69.57 
 
 
148 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  69.57 
 
 
148 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  69.57 
 
 
148 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  68.84 
 
 
148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  63.89 
 
 
145 aa  206  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  63.89 
 
 
145 aa  206  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 
145 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 
145 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  63.19 
 
 
145 aa  201  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  62.5 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  59.12 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  63.64 
 
 
145 aa  187  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  63.64 
 
 
145 aa  187  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  63.64 
 
 
145 aa  187  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  63.64 
 
 
145 aa  187  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  63.64 
 
 
145 aa  187  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  62.88 
 
 
145 aa  184  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  62.88 
 
 
145 aa  184  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  45.6 
 
 
154 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  45.6 
 
 
155 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  44.53 
 
 
151 aa  121  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  44.8 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  44 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  44 
 
 
152 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
154 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
154 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
154 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
154 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
154 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  41.46 
 
 
158 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
151 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  41.6 
 
 
154 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  41.46 
 
 
158 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1951  IS200 family transposase  59.26 
 
 
82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  41.46 
 
 
156 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  38.89 
 
 
156 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  36.36 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  37.9 
 
 
160 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  37.9 
 
 
160 aa  104  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  41.43 
 
 
200 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  37.12 
 
 
140 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  40.16 
 
 
130 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  36.23 
 
 
143 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  40.77 
 
 
137 aa  101  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  38.76 
 
 
136 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1138  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.130419  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2539  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3020  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0134798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0407  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000708618  hitchhiker  0.0000208321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0793  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365288  normal  0.44998 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3065  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3031  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000139818  normal  0.117471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3124  insertion sequence transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000108202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2930  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2576  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0581  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal  0.258801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0363  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1029  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  38.28 
 
 
142 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2455  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  38.06 
 
 
169 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>