82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2404 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 321 aa  662    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  34.49 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 		 366 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 		 375 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.11 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  34.56 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  32.12 
 
 		 375 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  37.42 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  34.9 
 
 		 387 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  35.25 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.99 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.99 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.29 
 
 		 313 aa  156  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  32.57 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  33.44 
 
 		 377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  32.14 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  31.94 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.79 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  33.21 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.52 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.35 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.13 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 		 528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 		 531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 534 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  29.77 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.08 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  29.75 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 		 534 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  30.85 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.74 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  29 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  28.27 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  27.49 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2991  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0913946  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  24.33 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 170 aa  49.3  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 530 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0067  hypothetical protein  32.77 
 
 		 186 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1080  hypothetical protein  34.78 
 
 		 151 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.750071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>