107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0691 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  94.05 
 
 		 336 aa  648    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 344 aa  697    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  52.13 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  47.58 
 
 		 336 aa  325  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  35.86 
 
 		 315 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  34.28 
 
 		 348 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  35.01 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  34.47 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 388 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 386 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  33.44 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 384 aa  178  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  34.55 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 361 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  32.48 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 534 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  31.83 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 528 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 534 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  31.61 
 
 		 387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.36 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  32.85 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.36 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.04 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.36 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.36 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.36 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.36 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.36 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  30.79 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.04 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.04 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.87 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.32 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.19 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  30.63 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.62 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  28.3 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.56 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.56 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  28.16 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  28.25 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  28.37 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  30.1 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.77 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  29.37 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 228 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  22.38 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1325  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  22.38 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000284432  hitchhiker  0.00284923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2967  putative metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 196 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 291 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1808  hypothetical protein  38.57 
 
 		 193 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1547  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  30.63 
 
 		 507 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  24.51 
 
 		 536 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  30.63 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 530 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1525  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 		 161 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 518 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1043  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  24.03 
 
 		 488 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.862003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  34.21 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  27.64 
 
 		 535 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  27.64 
 
 		 535 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0067  hypothetical protein  35.14 
 
 		 186 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>