79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2675 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 384 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  75.39 
 
 		 375 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  71.2 
 
 		 366 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  67.71 
 
 		 386 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  66.15 
 
 		 388 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  62.04 
 
 		 377 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  59.38 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  55.7 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 		 348 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  38.05 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 		 534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 531 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  35.92 
 
 		 528 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 534 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  37.15 
 
 		 295 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  36.16 
 
 		 324 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  33.23 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  36.79 
 
 		 322 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.31 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.88 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.88 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.04 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.96 
 
 		 313 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  33.65 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.65 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  32.51 
 
 		 316 aa  157  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.47 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.47 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.47 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.58 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.14 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.14 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.14 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.58 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.14 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.14 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  31.49 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 		 354 aa  137  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  29.87 
 
 		 313 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  30.42 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  30.8 
 
 		 313 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 352 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  30.21 
 
 		 314 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 309 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  29.11 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  27.46 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 320 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 		 170 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0662  putative hydrolase  34 
 
 		 191 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 		 187 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>