20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0662 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0662  putative hydrolase  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1363  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2967  putative metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 
295 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 
534 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1019  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.103134  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2873  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.01 
 
 
324 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  23.2 
 
 
249 aa  45.1  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
384 aa  44.7  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 
534 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 
366 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
388 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
386 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.06 
 
 
313 aa  42  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  33.98 
 
 
375 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
528 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1457  hypothetical protein  31.96 
 
 
233 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
531 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>