79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1988 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
295 aa  590  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 
375 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 
366 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  36.43 
 
 
375 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  38.91 
 
 
371 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
386 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  37.15 
 
 
384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  40.87 
 
 
387 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
377 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
361 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  37.46 
 
 
348 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  34.6 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
344 aa  185  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  37.46 
 
 
328 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  36.2 
 
 
315 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.8 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 
343 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  36.46 
 
 
324 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 
343 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  37.92 
 
 
361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  35.31 
 
 
376 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.57 
 
 
314 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.57 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 
534 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 
320 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 
327 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
534 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 
531 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 
528 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 
347 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.62 
 
 
313 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  33.45 
 
 
322 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
336 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.71 
 
 
313 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.71 
 
 
313 aa  148  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  37.22 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  28.88 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.88 
 
 
323 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  27.57 
 
 
326 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  35.69 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  32.74 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  30.51 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 
354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  28.62 
 
 
326 aa  125  6e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 
333 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  31.54 
 
 
325 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  31.74 
 
 
314 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  30.74 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 
352 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  29.39 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
228 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0662  putative hydrolase  25.44 
 
 
191 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0683  HDIG  30.36 
 
 
695 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.165123  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15171  HD superfamily hydrolase  30.36 
 
 
659 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.450871  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  24.58 
 
 
210 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1835  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 
212 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>