102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0667 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
336 aa  678    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  94.05 
 
 
344 aa  648    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  53.05 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  48.18 
 
 
336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 
352 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
315 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  35.31 
 
 
344 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 
348 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 
375 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  34.6 
 
 
295 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 
388 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 
386 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 
366 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 
320 aa  185  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  33.02 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  33.55 
 
 
321 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
384 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.12 
 
 
328 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
327 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
343 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
371 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
377 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
361 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
534 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 
347 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 
347 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
531 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
528 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 
534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.33 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  30.63 
 
 
387 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.98 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.33 
 
 
314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.33 
 
 
314 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.33 
 
 
314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.33 
 
 
314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.33 
 
 
314 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 
333 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.98 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.98 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.33 
 
 
314 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  31.58 
 
 
322 aa  142  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.68 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.99 
 
 
376 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.03 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  29 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  29.26 
 
 
325 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  29.3 
 
 
313 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  29.86 
 
 
295 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  29.37 
 
 
313 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.53 
 
 
313 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  28.53 
 
 
313 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  31.6 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  27.8 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  27.78 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  30.52 
 
 
323 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.19 
 
 
323 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
354 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  26.95 
 
 
316 aa  119  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 
317 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  29.72 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 
228 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1325  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  22.38 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000284432  hitchhiker  0.00284923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2967  putative metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
196 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
199 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
287 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  30.63 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  30.63 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1808  hypothetical protein  37.14 
 
 
193 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 
518 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1043  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 
488 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.862003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1547  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
512 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  24.25 
 
 
522 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1525  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
161 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  27.42 
 
 
535 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  27.64 
 
 
535 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
396 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  24.81 
 
 
522 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  34.21 
 
 
394 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  27.19 
 
 
517 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
396 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
396 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>