77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0049 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
371 aa  766    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  62.93 
 
 
375 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  64.27 
 
 
377 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  58.76 
 
 
366 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  66.35 
 
 
384 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  57.25 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  55.61 
 
 
386 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  50.66 
 
 
387 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 
375 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  41.27 
 
 
348 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  41.56 
 
 
320 aa  248  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  40.52 
 
 
328 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  39.72 
 
 
315 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
361 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 
315 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
295 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
531 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  36.7 
 
 
528 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 
534 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  37.54 
 
 
343 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
534 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  35.87 
 
 
347 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 
344 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  36.95 
 
 
327 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 
343 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  37.42 
 
 
321 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
361 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  40.15 
 
 
324 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.11 
 
 
318 aa  195  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.8 
 
 
314 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  37.11 
 
 
314 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  39.86 
 
 
347 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 
336 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  38.19 
 
 
316 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  38.46 
 
 
376 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
336 aa  186  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  37.81 
 
 
322 aa  185  9e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  36.63 
 
 
313 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  36.52 
 
 
313 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  36.52 
 
 
313 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 
295 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  35.21 
 
 
325 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  33.8 
 
 
313 aa  167  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  34.97 
 
 
313 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.23 
 
 
323 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  33.23 
 
 
323 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 
327 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  31.32 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  30.85 
 
 
326 aa  145  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 
354 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
352 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  28.85 
 
 
326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  29.03 
 
 
313 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  33.97 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
228 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
170 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2991  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
201 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0913946  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0662  putative hydrolase  32.35 
 
 
191 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.590888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>