41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1141 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 320 aa  660    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  31.87 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  29.21 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 361 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 		 187 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  27.44 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  31.82 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  23.96 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  30.48 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  34.26 
 
 		 941 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  36.04 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  29.25 
 
 		 640 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  21.13 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  25.74 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  24.23 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  33.09 
 
 		 616 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  31 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>