27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2021 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
287 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2132  metal dependent phosphohydrolase  66.84 
 
 
187 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2133  metal dependent phosphohydrolase  54.08 
 
 
98 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14287  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 
320 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
336 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  34.41 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 
534 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  31.4 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
347 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
416 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
344 aa  45.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0736  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 
703 aa  45.8  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0333299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  33.78 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>