78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0440 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
377 aa  776    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  68.63 
 
 
366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  61.48 
 
 
375 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  64.08 
 
 
371 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  67.62 
 
 
384 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  59.22 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  58.49 
 
 
386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  51.04 
 
 
387 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
375 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 
348 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  38.87 
 
 
328 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 
320 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 
315 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
361 aa  219  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
295 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 
534 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
534 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
531 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 
528 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
315 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
347 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
336 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 
344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
327 aa  180  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  33.44 
 
 
321 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.34 
 
 
324 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  35.16 
 
 
376 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  36.46 
 
 
322 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  33.44 
 
 
316 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.57 
 
 
313 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.57 
 
 
313 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.07 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.75 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  32.51 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 
295 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  34.2 
 
 
314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.55 
 
 
323 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
314 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  33.55 
 
 
323 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
327 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  31.96 
 
 
326 aa  143  5e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  29.72 
 
 
313 aa  143  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  30.42 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
333 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  27.94 
 
 
313 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
352 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  30.11 
 
 
314 aa  135  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  28.94 
 
 
326 aa  132  9e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 
309 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 
330 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  27.74 
 
 
313 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
309 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 
317 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
228 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
228 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 
249 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 
320 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2313  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0277696  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 
170 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2355  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0025797  decreased coverage  0.0000215512 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0662  putative hydrolase  30.4 
 
 
191 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.590888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>