45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0406 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  805    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1540  hypothetical protein  35.8 
 
 		 406 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1039  hypothetical protein  36.55 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.451358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  23.66 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  25.21 
 
 		 542 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  26.24 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.38 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2887  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.91 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  24.4 
 
 		 490 aa  53.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  22.27 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1817  oxidoreductase/nitrogenase component 1  24.76 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  24.64 
 
 		 347 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.5 
 
 		 522 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0407  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  25.17 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.73 
 
 		 544 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  22.42 
 
 		 539 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.81 
 
 		 533 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.37 
 
 		 508 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0236  oxidoreductase/nitrogenase component 1  27.06 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.690347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.57 
 
 		 541 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  22.83 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  21.86 
 
 		 458 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.41 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30 
 
 		 539 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  23.5 
 
 		 518 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1565  nitrogenase  22.49 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016954  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2304  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  29.09 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  28.75 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.93 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.93 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1632  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  22.46 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00463409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.83 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2273  nitrogenase associated protein N  23.48 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  27.61 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  26.36 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2330  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.28 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  21.77 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.36 
 
 		 568 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  19.13 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.32 
 
 		 544 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  21.24 
 
 		 563 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.01 
 
 		 546 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1235  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.53 
 
 		 463 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1517  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  23.53 
 
 		 463 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.302679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>