21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4820 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  100 
 
 		 487 aa  992    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  51.32 
 
 		 460 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  50.44 
 
 		 453 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  25.72 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.67 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  27.51 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  25.87 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  24.85 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  23.66 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  24.26 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  23.31 
 
 		 466 aa  96.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  22.41 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  22.47 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  23.48 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  27.59 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  24.26 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  22.51 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 428 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  22.61 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>