21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4363 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  100 
 
 		 387 aa  791    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  56.17 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  54.14 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  45.82 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  37.86 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  35.23 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  36.61 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  36.61 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  35.81 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  34.1 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  37.25 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  36.49 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  36.54 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  35.41 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  35.98 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  35.76 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  31.58 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  29.46 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  31.95 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  25.38 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  26.12 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>