More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4023 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4023  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 350 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  72.67 
 
 		 346 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1627  rod shape-determining protein MreB  69.86 
 
 		 348 aa  481  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2010  rod shape-determining protein MreB  75.75 
 
 		 346 aa  482  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0860436  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  69.1 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  62.99 
 
 		 346 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  62.94 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  64.44 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  60.76 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  58.86 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  58.54 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  58.54 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0473  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 		 348 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.836992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  58.7 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  56.59 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  55.99 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  56.46 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  56.25 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  54.76 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.62 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 		 345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 		 345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  55.19 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  58.01 
 
 		 352 aa  362  6e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3334  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000427845  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  54.01 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_002978  WD1258  rod shape-determining protein MreB  58.81 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  54.76 
 
 		 347 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  54.76 
 
 		 347 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 		 346 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  54.73 
 
 		 348 aa  358  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  54.46 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  53.3 
 
 		 347 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  53.58 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  54.46 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  54.73 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  55.45 
 
 		 344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  57.01 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>