More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2360 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  100 
 
 
259 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  65.08 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  59.77 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  42.51 
 
 
278 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  41.86 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  40 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  41.02 
 
 
258 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  40 
 
 
268 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.31 
 
 
260 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  40.8 
 
 
272 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  39.58 
 
 
271 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  39.45 
 
 
258 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  42.86 
 
 
271 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.33 
 
 
271 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.67 
 
 
253 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  42.79 
 
 
264 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  38.84 
 
 
274 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  38.43 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  39.33 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  38.52 
 
 
270 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  40.95 
 
 
272 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  40.95 
 
 
272 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  38.67 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  38.72 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  40.87 
 
 
273 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  37.6 
 
 
266 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  40.68 
 
 
270 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  39.92 
 
 
270 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  38.75 
 
 
275 aa  141  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  40 
 
 
273 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  41.26 
 
 
265 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  35.94 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  40.79 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  40.25 
 
 
269 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  38.93 
 
 
270 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  40.54 
 
 
254 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  38.39 
 
 
272 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  40.6 
 
 
269 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  41.88 
 
 
402 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.58 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  32.37 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.71 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.71 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.71 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  34.3 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  29.1 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.79 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.12 
 
 
272 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  36.33 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.58 
 
 
270 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.25 
 
 
270 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  34.16 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  36.53 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0518  inositol monophosphatase  33.47 
 
 
272 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.84 
 
 
270 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.43 
 
 
270 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.79 
 
 
270 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4200  inositol monophosphatase  35.12 
 
 
277 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0701939  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1404  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.78 
 
 
266 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.19036  normal  0.16729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2058  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.02 
 
 
274 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  32.91 
 
 
293 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.42 
 
 
269 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1815  inositol monophosphatase  36.21 
 
 
275 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.13 
 
 
270 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2973  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.61 
 
 
278 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2587  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.61 
 
 
285 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.88 
 
 
270 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0425  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.22 
 
 
273 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3922  inositol monophosphatase  35.54 
 
 
278 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00186914  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  31.4 
 
 
281 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6561  CysQ protein  34.58 
 
 
278 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.8 
 
 
275 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  32.34 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.1 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0394  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  31.6 
 
 
275 aa  99.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4940  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  33.06 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  28.99 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3378  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.82 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4249  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.5 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3411  Inositol-phosphate phosphatase  37.16 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.02 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12791  CysQ-like protein  29.88 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.386553  normal  0.0458292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.98 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4101  histidinol-phosphate phosphatase, putative  33.75 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.332683 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.02 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.84 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.38 
 
 
237 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0261  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.93 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.014346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5401  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.2 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0276  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.51 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  30.15 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0980  histidinol-phosphate phosphatase  33.04 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  33.33 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.35 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.56 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0286  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.4 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1650  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase  27.69 
 
 
324 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  34.8 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>