More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2065 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
472 aa  952    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  57.48 
 
 
470 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  54.09 
 
 
467 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
467 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  56.34 
 
 
471 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  55.97 
 
 
467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  54 
 
 
467 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  53.66 
 
 
467 aa  488  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.6 
 
 
470 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 
467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.97 
 
 
469 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
471 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.2 
 
 
475 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
477 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  48.92 
 
 
479 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 
468 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  47.1 
 
 
474 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  46.88 
 
 
468 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  43.56 
 
 
469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  45.81 
 
 
468 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  48.04 
 
 
484 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
468 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
486 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
463 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  47.45 
 
 
473 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  49.04 
 
 
478 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  44.52 
 
 
503 aa  387  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  41.54 
 
 
479 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  43.6 
 
 
446 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
475 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  42.73 
 
 
473 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
452 aa  356  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
469 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  41.83 
 
 
485 aa  342  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.7 
 
 
461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  44.75 
 
 
467 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  43.07 
 
 
469 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
496 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.19 
 
 
476 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  39.37 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
486 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.29 
 
 
496 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  38.04 
 
 
476 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
476 aa  310  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
500 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
500 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
500 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  38.61 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.27 
 
 
482 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.27 
 
 
482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  43.69 
 
 
459 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.27 
 
 
482 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.27 
 
 
482 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.02 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.77 
 
 
490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  37.81 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  38.12 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
494 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  36.79 
 
 
497 aa  303  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 
477 aa  302  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.53 
 
 
501 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
494 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.12 
 
 
490 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
490 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
487 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
499 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.03 
 
 
484 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.02 
 
 
494 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
495 aa  300  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
499 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
499 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.59 
 
 
494 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.55 
 
 
473 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
499 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
486 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.43 
 
 
492 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
494 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
494 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 
493 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
494 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
488 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
494 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
494 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
494 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.38 
 
 
494 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.6 
 
 
494 aa  296  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  37.14 
 
 
499 aa  296  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>