32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1024 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  100 
 
 		 119 aa  245  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.17 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.68 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.37 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  40.37 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40.37 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  36.97 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  39.29 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  36.29 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  38.68 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  38.68 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  38.68 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2589  hypothetical protein  35.94 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3208  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.14 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0903  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.9 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2590  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  42.42 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  33.59 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2535  Limonene-12-epoxide hydrolase  36.47 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.253274  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3045  hypothetical protein  30.23 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0391  limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.17 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3985  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.82 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174553  normal  0.332359 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  23.77 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2578  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.52 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  31 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2400  limonene-1,2-epoxide hydrolase  53.49 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0357  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.71 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3372  hypothetical protein  25.58 
 
 		 143 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3314  limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.42 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.225216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  29.09 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  30.19 
 
 		 134 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>