27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0983 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  100 
 
 		 416 aa  838    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1809  FkbM family methyltransferase  33.18 
 
 		 233 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3134  FkbM family methyltransferase  31.6 
 
 		 227 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2545  methyltransferase FkbM  32.49 
 
 		 242 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1424  FkbM family methyltransferase  30.33 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  38.46 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3719  methyltransferase FkbM  34.45 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171567 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4187  FkbM family methyltransferase  32.97 
 
 		 234 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3594  methyltransferase FkbM  30.58 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  31.37 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  33.92 
 
 		 818 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  35.06 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.48 
 
 		 778 aa  66.6  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.21 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1297  methyltransferase FkbM  34.34 
 
 		 234 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  31.98 
 
 		 731 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  26.67 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  28.38 
 
 		 509 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  23.53 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2163  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.62 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000531315 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  50 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2145  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  40.28 
 
 		 1080 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  25 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4789  methyltransferase FkbM family  19.7 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1182  hypothetical protein  26.17 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  24.83 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>