32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  57.25 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  49.25 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  51.09 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  47.06 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  48.99 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  47.17 
 
 		 215 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  39.55 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  36.61 
 
 		 212 aa  126  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  38.38 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  37.89 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  44.67 
 
 		 217 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  45.1 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  46.58 
 
 		 197 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  40.26 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  39.15 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0158  hypothetical protein  42.76 
 
 		 165 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.904262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  37.82 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  31.84 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  40.76 
 
 		 226 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  42.24 
 
 		 224 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  41.6 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  38.1 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  38.51 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  31.13 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  29.85 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  25.64 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  34.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  31.53 
 
 		 560 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  32.17 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5870  hypothetical protein  24.06 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.192295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>