31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4994 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  48.82 
 
 
226 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  46.59 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  43.65 
 
 
219 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  44.57 
 
 
215 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  45.81 
 
 
231 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  38.5 
 
 
316 aa  132  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  39.23 
 
 
211 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  41.11 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  40.44 
 
 
208 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  47.1 
 
 
217 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0158  hypothetical protein  46.15 
 
 
165 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.904262  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  46.38 
 
 
233 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  37.16 
 
 
236 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  43.65 
 
 
211 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  41.04 
 
 
221 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  45.11 
 
 
197 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  32.33 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  37.42 
 
 
289 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  31.3 
 
 
273 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  34.67 
 
 
302 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  38.26 
 
 
283 aa  91.7  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  40.52 
 
 
275 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  37.1 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  28.65 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0143  hypothetical protein  36.36 
 
 
205 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  35.64 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  26.82 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  26.8 
 
 
204 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  32.99 
 
 
560 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>