30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3654 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3654  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4036  hypothetical protein  91.58 
 
 		 273 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150015  hitchhiker  0.0050181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4746  hypothetical protein  52.27 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1238  hypothetical protein  43.24 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  0.0188331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0591  hypothetical protein  38.89 
 
 		 219 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1811  hypothetical protein  48.85 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1898  hypothetical protein  45.32 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2091  hypothetical protein  45.71 
 
 		 302 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173629  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6159  hypothetical protein  36.41 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1129  hypothetical protein  48.91 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0455873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2130  hypothetical protein  44.86 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0005588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2559  hypothetical protein  43.97 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29990  hypothetical protein  38.38 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0490987  normal  0.279629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1405  hypothetical protein  43.94 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0207185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4156  hypothetical protein  41.94 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0640  hypothetical protein  43.79 
 
 		 226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0201  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0158  hypothetical protein  43.38 
 
 		 165 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.904262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4524  hypothetical protein  39.23 
 
 		 211 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116106 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4392  hypothetical protein  38.51 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4994  hypothetical protein  34.41 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4456  hypothetical protein  33.87 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  35.11 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3681  hypothetical protein  36.81 
 
 		 224 aa  96.3  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4576  hypothetical protein  37.88 
 
 		 233 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  37.39 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0292  hypothetical protein  33.04 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0424844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1129  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3008  hypothetical protein  27.83 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>